近日,Plant Journal在線發(fā)表了以西北農(nóng)林科技大學(xué)為*署名單位、農(nóng)學(xué)院小麥非生物脅迫機(jī)理研究團(tuán)隊和生命科學(xué)學(xué)院生物信息學(xué)研究團(tuán)隊合作的研究論文“ Hybrid sequencing reveals insight into heat sensing and signaling of bread wheat ”。在小麥耐熱分子機(jī)制研究方面取得進(jìn)展
隨著全球變暖加劇,高溫已成為制約小麥生產(chǎn)的主要逆境因子之一。前期研究表明,小麥灌漿籽粒在高溫脅迫下的適應(yīng)性響應(yīng)有助于維持灌漿速率的穩(wěn)定(Journal of Experimental Botany,2018,PMID:30476278),但是,小麥?zhǔn)侨绾胃惺芎蛡鬟f高溫信號,并*終啟動高溫脅迫適應(yīng)性響應(yīng)的,尚不明確。該研究充分利用三代測序和二代測序的技術(shù)優(yōu)勢,對連續(xù)時間點高溫脅迫下,小麥旗葉和灌漿籽粒的時空轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行了系統(tǒng)研究。結(jié)果表明,小麥對高溫脅迫的響應(yīng)速度遠(yuǎn)高于其它非生物脅迫,并*次鑒定到了熱激轉(zhuǎn)錄因子(高溫信號傳遞通路中的末端轉(zhuǎn)錄因子)的上游信號。
另外,小麥不同組織器官、不同亞基因組和不同調(diào)控方式之間,在高溫脅迫響應(yīng)過程中存在明顯差異。針對小麥基因組的多倍體特性以及三代測序數(shù)據(jù)高錯誤率的問題,該研究開發(fā)的二代和三代轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)整合分析的生物信息學(xué)流程,為小麥等多倍體物種的大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析提供了新技術(shù)和新思路。
農(nóng)學(xué)院青年教師、生物學(xué)流動站博士后王曉明為*作者,生命科學(xué)學(xué)院馬闖教授和農(nóng)學(xué)院許盛寶副教授為論文共同通訊作者。本研究得到國家自然科學(xué)基金、西北農(nóng)林科技大學(xué)引進(jìn)人才啟動經(jīng)費的資助。
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